明洪武年，设镇远、清浪、铜鼓、五开、偏桥、古州、清平、兴隆8卫。
永乐十一年（1413年），废思州等宣慰司,置思州、镇远、黎平、新化4府，隶属贵州布政使司。
宣德九年（1434年），撤新化府并入黎平府。
正统九年（1444年），置施秉、永从2县。
弘治七年（1494年），置麻哈州及清平县，十一年（1498年），置镇远县。
万历二十五年（1597年），置天柱县，二十八年（1600年），置黄平州。
清康熙年间，镇远、偏桥、清平3卫分别并入镇远、施秉、清平县，兴隆卫并入黄平州。清雍正七年（1729年），置丹江厅驻丹江（今老丹江），属都匀府。
同治十一年（1872年），迁丹江厅驻肇庆堡（今县城）。
民国二年（1913年），改丹江厅为丹江县，属黔中道。民国三十年（1941年），撤销丹江县，并入台拱、八寨两县。民国三十三年（1944年），设置雷山设治局，属第一行政督察区。
1950年，雷山设治局改为雷山县至今。
